蒋在珍当时任职新8师师长，部队就在荥泽以下至赵口一带驻防，蒋在珍对水利这方面颇感兴趣，而且还做过比较深入的研究。
因此当赵口决堤时他没事就会跑过去观看，当看到三次决堤三次失败后，蒋在珍再也按耐不住，主动跟魏汝霖请示，说他可以在花园口决堤。
但这么大的事魏汝霖做不了主，因此才会跟商震作汇报。
不久后，蒋在珍跟着魏汝霖一同来到了20集团军司令部。蒋在珍问候完毕后，主动跟商震请求炸花园口的任务，并强调：“如是不成，军法从事。”
商震此时也没有别的办法，只能死马当活马医了，同意了蒋在珍的请求。
当晚11点，蒋在珍召开了一次重要会议，并就花园口决堤一事做了部署：“7日上午7点，投入两个团加一个工兵连的兵力在花园口龙王庙西侧决堤。”
会议结束后，新8师负责警戒的官兵奉命前往花园口，以决口处为中心，将住在附近的居民叫起，告诉他们日寇即将进攻此地，为了保证安全让他们搬迁到10里之外去。
善良的居民们哪里知道国民党要炸黄河，一听鬼子要来，二话不说的就扶老携幼的离开了。
7日凌晨时分，蒋在珍在花园口上设立了指挥部。
7点一到，立即下令动工。800名由他精挑细选出来的精壮士兵，被分为了5个组，每组分成两个班，一班负责挖掘，一班负责搬运，每组工作两小时后轮替。
因为指挥得当，加上蒋在珍十分重视劳逸结合，决口工作进行的十分顺利，据蒋在珍估计，最早应该能在9日午时左右放水
9日清晨，魏汝霖来到花园口，对施工的士兵们表示：统帅部对他们的表现很满意，如果能在12点前成功放水，战区程长官（程潜）会奖励3000块法币。
士兵们听后斗志更加高涨，只用了一个小时就完成了所有的任务，挖出了一个上宽50米，下宽5米的缺口，缺口内留下一层一米多厚的堤坎，暂时阻止水往外流动。
当日9时，两名士兵划船来到堤坎边将其凿开后，汹涌的黄河之水顿时汹涌而出。看着这一幕，新8师的军士无不欢呼雀跃，纷纷高呼：“决堤成功啦！”
蒋在珍没有跟士兵们一起庆贺，而是直接跑回司令部，请商震调来了炮兵，对挖薄了的堤岸进行炮击，缺口因此扩大至7、8米。
巧合的是，当时天上正电闪雷鸣下着大雨，黄河水暴涨，因此缺口越冲越大，赵口之前挖掘的缺口也随着水流的冲击被冲开了，水流奔涌而出。
魏汝霖对这一情况十分满意，拍着蒋在珍的肩膀表示一定会为他请功。
然而蒋在珍本人却高兴不起来，看着因为大水被冲垮的百姓房屋，以及在大水中沉沉浮浮的各类牲畜，蒋在珍叹了一口气，说道：“是非功过，就让后人评说去吧。”
黄河水下泄后，西边的水一路沿颍河汇入淮河，东边的水一路沿涡河进入淮河，然后涌入洪泽湖，直接导致豫、皖、苏3省44县被淹，受灾面积高达290000平方公里。
在国民党军挖掘黄河大堤之时，日寇已经通过飞机侦察的方式预测到了国民党军的想法，于是纷纷抢占制高点。
黄河决堤后，日寇第14师团虽然大部分被洪水围困在了中牟县，但是日军第二军迅速派出了大量部队赶往支援，因此并没有遭受多少损失。
而日寇第十六师团因为处于洪水中心的缘故，损伤较大，被淹死了1000人左右。
趁此机会，国军开始发动反攻，基本上肃清了豫东一带的所有日军，加上被水淹死的1000余名日军，这次日军总共损失了7000余人。
相较于日本人而言，中国方面的损失可以说是异常惨重。
6月12日，花园口、赵口决堤而出的两股水流合在一起，水深高达两米，数十里开外的白沙镇直接被水流冲成了废墟。
13日，黄河水流至中牟县以东区域，然后继续向东流入尉氏。水流在中牟时只有4、5里宽，进入尉氏后直接扩展至了十余里，而且还大有继续扩展的趋势，沿途村庄无一幸免，全部变为泽国。
进入6月下旬后，决堤而出的黄河水流入淮河，淮河承运负担陡增，日军正在建造的淮河铁桥直接被水冲塌，黄河之水也蔓延至了安徽、江苏境内。
7月，花园口、赵口两处缺口经河水冲刷已宽至上百米。此时才后知后觉的反应过来酿成滔天大祸的国民政府，面对这种灾难深感无能为力，只得望洋兴叹。
当然，国民党打死都不会承认花园口决堤是自己干的了，他们把水灾扩大的责任一股脑的甩到了日军的头上。
6月13日，中央社发文称：因为日军在黄河边上投放了数十枚炸弹，将黄河决口炸大，导致水势汹涌无法挽救。
很快，日本人命人炸毁黄河堤岸的消息就传遍了全世界，日本政府当即通过电台、报纸发表声明，称此事是国民党嫁祸于日本的阴谋诡计。
有记者专门就此事采访了国民党军事委员会政治部部长陈诚，当记者说日本方面称决口是中国政府自己炮制的恶作剧时，陈诚当即愤怒的表示：
“无耻之尤！日寇惯用欺骗宣传，他不但不知悔忏，反而血口喷人，把毁堤罪行移解到我们身上，令人愤慨之至！此种诬报，毋庸辩驳，相信并且希望，是绝对不会淆惑世界公正人士视听的。”
后来，国民政府邀请了一大群中外记者前往花园口，让记者们拍下了无数军民奋身堵塞决口的景象。
因为国民党方面事先做了大量的准备工作，所以中外记者们没有发现任何的异常，真的相信了花园口决堤是日机轰炸造成的。
而当时国内大部分民众也相信了国民政府的宣传，因为他们早就见识过了日寇的虚假宣传，普遍相信此事是日本政府在贼喊捉贼。
虽然在花园口决堤之前，国民党方面曾出台过一份文件，说决口开始前必须将附近的农民全部迁移、安置，妥善处理，避免他们流离失所，无法生存。
然而，如果这份文件真的能落实，那国民党就不会在短短三年内就被解放军赶到台湾去了。
花园口决堤后，大量百姓被洪水活活淹死，仅中牟县就有6万百姓死于非命。
据当时统计，有1200万名居民因为大水无家可归，89万多名百姓被大水冲走死于非命。
仅河南一省，就有900多万亩耕地被大水淹没，140余万户民宅被大水冲毁。洪水所过之处，无不哀鸿遍野。
黄河水下泄后，西边的水一路沿颍河汇入淮河，东边的水一路沿涡河进入淮河，然后涌入洪泽湖，直接导致豫、皖、苏3省44县被淹，受灾面积高达290000平方公里。
随着花园口的决口越冲越大，黄河下游的故道逐渐干涸，黄河水就此彻底改道。
因为没有固定的河道，黄河水就在三省之间滚来滚去，形成了一片长400公里，宽10公里~80公里不等的黄泛区。
面对因大水产生的灾民，国民政府拨款5亿法币用来赈灾，扣除掉被国民政府官员贪污掉的法币，每名灾民只能领到10元赈济款。
当那些从水中挣扎着爬上岸的老百姓们，接过国民政府赈灾人员流着眼泪送来的10块钱法币时，无不痛哭流涕的哀嚎道：“家都没了，我们要这10块钱有多少用啊!”
黄河夺淮入海的影响是空前的，正是因为黄河将100亿吨泥沙带入淮河，直接导致淮河干流及支流严重堵塞，此后淮河年年发大水。
汛期来了，黄河、淮河发大水，洪灾结束了蝗灾又来了。
与此同时，因为黄河决口，导致河南省大部分土地都成了盐碱地或者沙地，河南庄稼大片绝产。
进入1942年春天后，河南又迎来了长达数年的大旱，全省滴雨未下，再加上国民政府救灾不力，直接导致河南爆发了惨绝人寰的大饥荒，3000万人受灾，300万人饿死。
花园口决堤客观上的确延缓了日军的侵略步伐，日寇被迫放弃了从平汉线进攻武汉的计划，只得退守徐州。
之后日军改道过淮河前往合肥，和其他日军汇合后从长江北岸入侵武汉。
蒋介石因此争取了数月的时间，武汉大量的重工业设施顺利转移到了西南大后方。
但是不管怎么说，炸花园口造成的影响实在太恶劣了。蒋介石也知道自己干了一件多么缺德的事情，因此下令严禁任何人对外透露此事真相，他本人更是坚决不肯承认是自己下令扒开的花园口。
1945年日本投降后，蒋介石假惺惺地表示是时候让黄泛区人民早日回家了。下令堵塞花园口，让黄河回归故道。
这项工程一直持续到了1947年的3月15日，花园口的决口才成功堵塞。此时，距离花园口决堤已经过去了8年零9个月了。